Na linii S3 nie wprowadzono zmian. Zgodnie z informacją przekazaną przez przedstawicieli Warszawskiego Transportu Publicznego pociągi kursują według dotychczasowego rozkładu.
Więcej nowości dotyczy linii S40. Od 1 września w dni powszednie uruchomione będą dodatkowe kursy: z Radzymina o 4:52 i 21:52 oraz z Piaseczna o 19:10 i 21:10. Kontynuowana będzie także weekendowa oferta dojazdu nad Zalew Zegrzyński. We wrześniu pociągi S40 w relacji Warszawa Zachodnia (peron 9) – Radzymin kursują w soboty i niedziele. Od października weekendowe połączenia z Radzyminem będą dostępne tylko w soboty, a pociągi pojadą w podstawowej relacji – z Piaseczna.
Szczegółowe rozkłady jazdy obowiązujące od 31 sierpnia 2025 r. są dostępne na stronie internetowej Warszawskiego Transportu Publicznego.
W przypadku Kolei Mazowieckich (KM) i linii R9 (Warszawa – Działdowo) zmiany są niewielkie. Wydłużono relacje niektórych pociągów na terenie północnej części Mazowsza, jednak dla mieszkańców powiatu legionowskiego nie ma to większego znaczenia.
Rozkłady jazdy KM dostępnie są na stronie internetowej przewoźnika.
Korekta obejmuje również połączenia regionalne i dalekobieżne. W wybranych relacjach zmodyfikowano godziny odjazdów i skrócono czas podróży. Przykładowo podróż pociągiem Pendolino z Warszawy Centralnej do Szczecina Głównego trwa obecnie 4 godziny i 12 minut. Kilka lat temu - w 2018 roku było to ponad 6 godzin.